生物学研究已从传统的群体平均水平转向更加精细的单细胞层面。单细胞蛋白质组学(single-cell proteomics, SCP)作为研究细胞异质性、动态变化和细胞功能的重要工具,正以前所未有的速度推动系统生物学的进展。尤其是高通量单细胞蛋白质组学的出现,不仅突破了蛋白质组学的技术瓶颈,还为揭示复
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单细胞RNA测序(RNA-seq)和单细胞蛋白质组学(single-cell proteomics)是探索细胞功能、异质性和生物学过程的两项核心技术,它们为解码生命现象提供了精确的数据。然而,单独依赖RNA-seq或蛋白质组学并不能完整描绘细胞的生物学特征,因为RNA水平并不总是与蛋白质表达及其功能
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在大规模蛋白质组学研究中,数据独立采集(DIA, Data-Independent Acquisition)技术因其高通量、高重现性和数据完整性,已成为主流。然而,DIA的发展也催生了多种策略,其中以GPF-DIA(Gas Phase Fractionation DIA)与Direct DIA(直接
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在蛋白组学研究中,选择合适的质谱采集方式是获得高质量数据的关键。目前,SWATH-MS(Sequential Window Acquisition of all Theoretical fragment ion spectra)与DDA-MS(Data-Dependent Acquisition)是
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在蛋白质组学研究中,蛋白质定量是理解生物系统动态变化的核心手段。随着质谱技术的发展,iTRAQ、SILAC 和无标记定量(Label-Free Quantification, LFQ)成为主流的三种定量策略。它们各具特点,适用于不同实验需求。 一、iTRAQ:异位标记,实现高通量多样本比较 1、原
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无标记定量(Label-Free Quantification, LFQ)技术因其流程简便、成本相对低廉、适用范围广泛,在基础生物学研究、疾病机制解析及生物标志物发现中被广泛采用。然而,LFQ数据处理复杂,涉及大规模质谱数据的特征提取、定量计算、差异分析及功能注释,研究者对数据处理工具的选择与使用尤
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SWATH-MS(Sequential Window Acquisition of All Theoretical Mass Spectra)作为基于数据独立采集(DIA)的质谱技术,近年来在蛋白组学研究中获得广泛应用。它以出色的重现性、高通量和广覆盖性,成为大规模样本定量分析的重要技术选择。而Op
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在现代生命科学研究中,蛋白质定量分析是揭示生物过程机制、疾病标志物筛选、药物作用机制解析等研究的重要手段。相较于蛋白质表达检测方法,定量蛋白组学(Quantitative Proteomics)具备高通量、灵敏度高、可实现多样本对比等优势。当前主流的蛋白质定量技术主要分为四类:iTRAQ、SILAC
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在现代生命科学研究中,蛋白质组学正从“定性识别”迈向“定量解析”的新阶段。定量蛋白质组学可以揭示不同处理条件下蛋白表达水平的动态变化,帮助科研人员从功能层面深入理解生物过程。在众多定量蛋白质组学方法中,无标记定量(Label-Free Quantifi
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数据独立采集(Data-Independent Acquisition, DIA)作为近年来质谱技术的重要进展,正在逐步取代数据依赖采集(DDA)方法,成为蛋白质定量研究的主流选择。DIA具有高通量、低缺失率和高重复性等显著优势,特别适合复杂生物样本的大规模蛋白组学研究。然而,DIA数据分析流程也存
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